Protein–RNA interactions for Protein: Q15024

EXOSC7, Exosome complex component RRP42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC7Q15024 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EXOSC7Q15024 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC7Q15024 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC7Q15024 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC7Q15024 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms