Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd3Q14AI6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms