Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNX2Q13950 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNX2Q13950 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX2Q13950 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms