Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H2Q13888 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H2Q13888 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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