Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SGCGQ13326 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGCGQ13326 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGCGQ13326 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGCGQ13326 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SGCGQ13326 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGCGQ13326 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGCGQ13326 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGCGQ13326 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGCGQ13326 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGCGQ13326 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGCGQ13326 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGCGQ13326 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGCGQ13326 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGCGQ13326 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SGCGQ13326 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SGCGQ13326 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SGCGQ13326 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGCGQ13326 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGCGQ13326 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
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