Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMA3FQ13275 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA3FQ13275 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA3FQ13275 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA3FQ13275 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
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