Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACACAQ13085 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACACAQ13085 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACACAQ13085 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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