Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 CDCA8-201ENST00000327331 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 PFAS-209ENST00000584044 557 ntTSL 412.01□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 PFKFB3-205ENST00000379789 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 SMG7-201ENST00000347615 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 CCDC14-207ENST00000433542 3260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 LARP4B-206ENST00000469487 859 ntTSL 211.96□□□□□ -0.495e-14■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 CCDC14-214ENST00000478956 555 ntTSL 411.92□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 NCAPH2-204ENST00000418794 640 ntTSL 511.83□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 ERBB3-207ENST00000549061 560 ntTSL 411.73□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 LIAS-208ENST00000638422 1776 ntTSL 511.62□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 CHRNB1-203ENST00000570557 947 ntTSL 511.57□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 ERBB3-209ENST00000549282 561 ntTSL 411.56□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 CHST15-205ENST00000628426 3553 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.575e-14■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 TEX10-201ENST00000374902 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 ST3GAL4-212ENST00000528858 763 ntTSL 311.4□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 SMG7-215ENST00000515829 5629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 CAMSAP1-207ENST00000483991 4342 ntTSL 211.38□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 CCDC14-201ENST00000310351 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 CCDC14-211ENST00000463996 374 ntTSL 211.27□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 VPS51-210ENST00000531146 594 ntTSL 211.24□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 TROAP-211ENST00000549891 932 ntTSL 1 (best)11.24□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 CHRNB1-208ENST00000576360 1837 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 LIAS-202ENST00000340169 1485 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 ITFG2-206ENST00000537851 1419 ntTSL 1 (best)11.11□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 LIAS-212ENST00000638837 1757 ntTSL 511.03□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 CHRNB1-205ENST00000573209 2394 ntTSL 211.03□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 PDPR-208ENST00000567046 1207 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 ZNF37BP-202ENST00000452075 8637 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 TEX10-204ENST00000535814 3006 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 PDPR-211ENST00000569042 598 ntTSL 410.75□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 TROAP-204ENST00000546776 1011 ntTSL 310.7□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 CCDC14-222ENST00000495381 3993 ntTSL 210.64□□□□□ -0.712e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 RALGAPA2-206ENST00000620717 1432 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.712e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 CDCA8-202ENST00000373055 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.722e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 DPCD-201ENST00000370147 641 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.722e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 LARP4B-204ENST00000440895 656 ntTSL 210.5□□□□□ -0.735e-14■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 LARP4B-209ENST00000608970 656 ntTSL 210.5□□□□□ -0.735e-14■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 TROAP-214ENST00000551192 1469 ntTSL 210.33□□□□□ -0.762e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 SLC6A8-206ENST00000457723 266 ntTSL 510.32□□□□□ -0.765e-14■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 ZMIZ1-203ENST00000472035 457 ntTSL 210.3□□□□□ -0.762e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 PACS1-202ENST00000524784 540 ntTSL 410.27□□□□□ -0.772e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 LIAS-222ENST00000640888 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.772e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 GSK3A-202ENST00000398249 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.812e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 CCDC14-203ENST00000409697 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.832e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 ST3GAL4-218ENST00000534452 550 ntTSL 59.85□□□□□ -0.832e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 TROAP-205ENST00000547807 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 39.84□□□□□ -0.832e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 LIAS-203ENST00000381846 1578 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.832e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 LIAS-217ENST00000640381 2259 ntTSL 59.7□□□□□ -0.862e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 CDK18-208ENST00000476153 954 ntTSL 39.65□□□□□ -0.862e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 DPCD-205ENST00000475443 731 ntTSL 39.62□□□□□ -0.872e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 CCDC14-210ENST00000438440 783 ntTSL 39.54□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 DPCD-203ENST00000434727 369 ntTSL 39.49□□□□□ -0.892e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 RPTOR-205ENST00000573163 501 ntTSL 39.46□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 LIAS-220ENST00000640689 2080 ntTSL 59.38□□□□□ -0.912e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 SMG7-202ENST00000367537 5970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 CHAF1A-206ENST00000587739 875 ntTSL 59.03□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 RALGAPA2-204ENST00000430436 8769 ntTSL 59.02□□□□□ -0.972e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 PLEKHH1-212ENST00000560100 638 ntTSL 49□□□□□ -0.972e-6■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 LIAS-213ENST00000639422 4115 ntTSL 58.83□□□□□ -12e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 SLC2A3-205ENST00000486749 4414 ntTSL 1 (best)8.79□□□□□ -15e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 CAMSAP1-206ENST00000482664 677 ntTSL 28.7□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 LIAS-210ENST00000638451 1159 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 TRIM66-208ENST00000531498 1210 ntTSL 1 (best)8.47□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 TEX10-203ENST00000477648 4457 ntTSL 28.25□□□□□ -1.092e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 TRIM28-214ENST00000600840 338 ntTSL 28.14□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 SLC2A3-204ENST00000479059 870 ntTSL 27.99□□□□□ -1.135e-7■■■■■ 49.4
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SF3A3Q12874 CFDP1-202ENST00000562602 699 ntTSL 37.76□□□□□ -1.172e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 LIAS-201ENST00000261434 1258 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.192e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 PFAS-210ENST00000585183 581 ntTSL 37.54□□□□□ -1.22e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 PFAS-206ENST00000581242 553 ntTSL 47.54□□□□□ -1.22e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 PACS1-211ENST00000531298 547 ntTSL 47.47□□□□□ -1.212e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.255e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 LIAS-216ENST00000640349 969 ntTSL 57.21□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 ITFG2-203ENST00000535564 449 ntTSL 37.19□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 PDPR-205ENST00000563930 551 ntTSL 47.16□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.282e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 TROAP-208ENST00000548817 480 ntTSL 37.02□□□□□ -1.292e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 CCDC14-216ENST00000483247 697 ntTSL 36.92□□□□□ -1.32e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.372e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 ERBB3-212ENST00000549672 676 ntTSL 46.41□□□□□ -1.382e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 PDE8A-213ENST00000560789 4664 ntTSL 26.26□□□□□ -1.412e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 LIAS-207ENST00000515061 662 ntTSL 36.21□□□□□ -1.422e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 LIAS-219ENST00000640672 1403 ntTSL 55.63□□□□□ -1.512e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 CCDC14-202ENST00000409657 3815 ntTSL 25.2□□□□□ -1.582e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 CFDP1-209ENST00000570103 663 ntTSL 25□□□□□ -1.612e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 CFDP1-204ENST00000564793 457 ntTSL 34.97□□□□□ -1.612e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 PDE8A-209ENST00000558543 644 ntTSL 34.88□□□□□ -1.632e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 SLC2A3-206ENST00000490763 943 ntTSL 24.45□□□□□ -1.75e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 LIAS-211ENST00000638816 675 ntTSL 54.29□□□□□ -1.722e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.722e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 PDE8A-206ENST00000557819 575 ntTSL 44.08□□□□□ -1.762e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 NOP58-206ENST00000478508 599 ntTSL 23.99□□□□□ -1.772e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 PDE8A-207ENST00000557954 586 ntTSL 43.96□□□□□ -1.782e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 SMG7-207ENST00000493045 673 ntTSL 33.73□□□□□ -1.812e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.922e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.56□□□□□ -22e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.272e-7■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 49.4
SF3A3Q12874 RAP1GAP-213ENST00000611549 4294 ntTSL 514.59□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 49.4
Retrieved 100 of 27,864 protein–RNA pairs in 685.4 ms