Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNMA1Q12791 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KCNMA1Q12791 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
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