Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 SUF5tG(CCC)O 72 nt7.09□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 ZRT2YLR130C 1269 nt7.09□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 PEX13YLR191W 1161 nt7.09□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 ECM38YLR299W 1983 nt7.09□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 YFL052WYFL052W 1398 nt7.08□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 ALT2YDR111C 1524 nt7.08□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 ILV1YER086W 1731 nt7.08□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 BUG1YDL099W 1026 nt7.08□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 ECM14YHR132C 1293 nt7.08□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 POP5YAL033W 522 nt7.08□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 MAK31YCR020C-A 267 nt7.07□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 BMT5YIL096C 1011 nt7.07□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 OPI8YKR035C 642 nt7.07□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 RKI1YOR095C 777 nt7.07□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 MIP1YOR330C 3765 nt7.07□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 PXL1YKR090W 2121 nt7.07□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 PMT3YOR321W 2262 nt7.06□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 LCB3YJL134W 1230 nt7.06□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 CAF40YNL288W 1122 nt7.06□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 MSS1YMR023C 1581 nt7.06□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 YLR123CYLR123C 330 nt7.05□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 GAA1YLR088W 1845 nt7.05□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 YLL067CYLL067C 3618 nt7.05□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 CLN1YMR199W 1641 nt7.05□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 AMD2YDR242W 1650 nt7.04□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 DOT5YIL010W 648 nt7.04□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 EXG1YLR300W 1347 nt7.03□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 NPL6YMR091C 1308 nt7.03□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 YET3YDL072C 612 nt7.03□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 YGR127WYGR127W 939 nt7.03□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 YNL285WYNL285W 372 nt7.03□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 KTR1YOR099W 1182 nt7.03□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 ENV7YPL236C 1095 nt7.03□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 PZF1YPR186C 1290 nt7.03□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 ENP1YBR247C 1452 nt7.03□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 BDF2YDL070W 1917 nt7.03□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 GEF1YJR040W 2340 nt7.02□□□□□ -1.28
CLF1Q12309 UTR2YEL040W 1404 nt7.02□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 HSP12YFL014W 330 nt7.02□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 TRP5YGL026C 2124 nt7.02□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 BUD32YGR262C 786 nt7.02□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 LDS1YAL018C 978 nt7.02□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 IRS4YKR019C 1848 nt7.01□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 ICL1YER065C 1674 nt7.01□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 SIT4YDL047W 936 nt7.01□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 THI4YGR144W 981 nt7.01□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 QCR8YJL166W 285 nt7.01□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 YMC1YPR058W 924 nt7.01□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 UTP4YDR324C 2331 nt7.01□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 SKS1YPL026C 1509 nt7.01□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 UTP6YDR449C 1323 nt7.01□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 HRQ1YDR291W 3234 nt7□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 ARP10YDR106W 855 nt7□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 GCV3YAL044C 513 nt7□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 UIP4YPL186C 915 nt7□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 LYS21YDL131W 1323 nt7□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 CTF8YHR191C 402 nt6.99□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 YLR312CYLR312C 1197 nt6.99□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 RRS1YOR294W 612 nt6.99□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt6.99□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 PCS60YBR222C 1632 nt6.98□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 SES1YDR023W 1389 nt6.98□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 AST1YBL069W 1290 nt6.98□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 IES2YNL215W 963 nt6.98□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 EFT2YDR385W 2529 nt6.98□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 EFT1YOR133W 2529 nt6.98□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 MCH1YDL054C 1461 nt6.98□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 HOS2YGL194C 1359 nt6.97□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 RPS5YJR123W 678 nt6.97□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 SCO2YBR024W 906 nt6.97□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 YML133CYML133C 4125 nt6.97□□□□□ -1.29
CLF1Q12309 PAP2YOL115W 1755 nt6.96□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 COX5AYNL052W 462 nt6.96□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 YOR200WYOR200W 399 nt6.96□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 IME2YJL106W 1938 nt6.95□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 GUF1YLR289W 1938 nt6.95□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 GLN3YER040W 2193 nt6.95□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 CDC11YJR076C 1248 nt6.94□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 SUR7YML052W 909 nt6.94□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 JNM1YMR294W 1122 nt6.94□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 MRPS16YPL013C 366 nt6.94□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 ARP3YJR065C 1350 nt6.94□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 GPB2YAL056W 2643 nt6.94□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 YEL020CYEL020C 1683 nt6.93□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 LAG2YOL025W 1983 nt6.93□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 DRS1YLL008W 2259 nt6.93□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 YIL077CYIL077C 963 nt6.93□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 OCA1YNL099C 717 nt6.93□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 RSC2YLR357W 2670 nt6.93□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 FPR2YDR519W 408 nt6.92□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 ECM19YLR390W 339 nt6.92□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 YMR147WYMR147W 672 nt6.92□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 KNS1YLL019C 2214 nt6.91□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 IMA2YOL157C 1770 nt6.91□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 YDL129WYDL129W 876 nt6.91□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 SEN34YAR008W 828 nt6.91□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 snR82snR82 268 nt6.9□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt6.9□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 YGL235WYGL235W 537 nt6.9□□□□□ -1.3
CLF1Q12309 CCP1YKR066C 1086 nt6.9□□□□□ -1.3
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