Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 ORC5YNL261W 1440 nt9.14□□□□□ -0.95
TY1B-BRQ12193 XBP1YIL101C 1944 nt9.13□□□□□ -0.95
TY1B-BRQ12193 TRR1YDR353W 960 nt9.13□□□□□ -0.95
TY1B-BRQ12193 LEU5YHR002W 1074 nt9.13□□□□□ -0.95
TY1B-BRQ12193 KTR1YOR099W 1182 nt9.13□□□□□ -0.95
TY1B-BRQ12193 GIT1YCR098C 1557 nt9.13□□□□□ -0.95
TY1B-BRQ12193 GUD1YDL238C 1470 nt9.13□□□□□ -0.95
TY1B-BRQ12193 CHA1YCL064C 1083 nt9.12□□□□□ -0.95
TY1B-BRQ12193 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt9.12□□□□□ -0.95
TY1B-BRQ12193 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt9.12□□□□□ -0.95
TY1B-BRQ12193 YGL235WYGL235W 537 nt9.12□□□□□ -0.95
TY1B-BRQ12193 MDL2YPL270W 2322 nt9.11□□□□□ -0.95
TY1B-BRQ12193 YKR032WYKR032W 315 nt9.11□□□□□ -0.95
TY1B-BRQ12193 BSC4YNL269W 396 nt9.11□□□□□ -0.95
TY1B-BRQ12193 BBP1YPL255W 1158 nt9.1□□□□□ -0.95
TY1B-BRQ12193 SLA2YNL243W 2907 nt9.1□□□□□ -0.95
TY1B-BRQ12193 YDR109CYDR109C 2148 nt9.1□□□□□ -0.95
TY1B-BRQ12193 PRO3YER023W 861 nt9.09□□□□□ -0.95
TY1B-BRQ12193 MCH2YKL221W 1422 nt9.09□□□□□ -0.95
TY1B-BRQ12193 COX16YJL003W 357 nt9.09□□□□□ -0.95
TY1B-BRQ12193 RTG2YGL252C 1767 nt9.08□□□□□ -0.96
TY1B-BRQ12193 PRM10YJL108C 1152 nt9.08□□□□□ -0.96
TY1B-BRQ12193 THI2YBR240C 1353 nt9.08□□□□□ -0.96
TY1B-BRQ12193 GAT3YLR013W 426 nt9.07□□□□□ -0.96
TY1B-BRQ12193 ATP14YLR295C 375 nt9.07□□□□□ -0.96
TY1B-BRQ12193 YGR176WYGR176W 348 nt9.07□□□□□ -0.96
TY1B-BRQ12193 DPH5YLR172C 903 nt9.07□□□□□ -0.96
TY1B-BRQ12193 RPL5YPL131W 894 nt9.07□□□□□ -0.96
TY1B-BRQ12193 TAH11YJR046W 1815 nt9.06□□□□□ -0.96
TY1B-BRQ12193 ALR1YOL130W 2580 nt9.06□□□□□ -0.96
TY1B-BRQ12193 MET2YNL277W 1461 nt9.05□□□□□ -0.96
TY1B-BRQ12193 SHM1YBR263W 1473 nt9.05□□□□□ -0.96
TY1B-BRQ12193 GTT3YEL017W 1014 nt9.05□□□□□ -0.96
TY1B-BRQ12193 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt9.05□□□□□ -0.96
TY1B-BRQ12193 QNS1YHR074W 2145 nt9.05□□□□□ -0.96
TY1B-BRQ12193 YDL034WYDL034W 345 nt9.04□□□□□ -0.96
TY1B-BRQ12193 QCR8YJL166W 285 nt9.04□□□□□ -0.96
TY1B-BRQ12193 GSH1YJL101C 2037 nt9.04□□□□□ -0.96
TY1B-BRQ12193 UFD1YGR048W 1086 nt9.04□□□□□ -0.96
TY1B-BRQ12193 PGU1YJR153W 1086 nt9.04□□□□□ -0.96
TY1B-BRQ12193 COX9YDL067C 180 nt9.03□□□□□ -0.96
TY1B-BRQ12193 CWC21YDR482C 408 nt9.03□□□□□ -0.96
TY1B-BRQ12193 SLO1YER180C-A 258 nt9.03□□□□□ -0.96
TY1B-BRQ12193 HSX1tR(CCU)J 72 nt9.03□□□□□ -0.96
TY1B-BRQ12193 YAP1801YHR161C 1914 nt9.03□□□□□ -0.96
TY1B-BRQ12193 IPI1YHR085W 1005 nt9.02□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 DJP1YIR004W 1299 nt9.02□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 ECM15YBL001C 315 nt9.01□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 DAL82YNL314W 768 nt9.01□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 GPH1YPR160W 2709 nt9.01□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 NOB1YOR056C 1380 nt9.01□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 YKL151CYKL151C 1014 nt9.01□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 AIM34YMR003W 597 nt9.01□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 NDC1YML031W 1968 nt9.01□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 TIM54YJL054W 1437 nt9□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 ATO3YDR384C 828 nt9□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 YHC3YJL059W 1227 nt9□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 CYB2YML054C 1776 nt8.99□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 GIR2YDR152W 798 nt8.99□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 YDR154CYDR154C 351 nt8.99□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 HCR1YLR192C 798 nt8.99□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 YMC1YPR058W 924 nt8.99□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 YBR144CYBR144C 315 nt8.99□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 YHM2YMR241W 945 nt8.99□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 CSG2YBR036C 1233 nt8.99□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 UTR4YEL038W 684 nt8.98□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 RTT106YNL206C 1368 nt8.98□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 CAD1YDR423C 1230 nt8.97□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 CIS3YJL158C 684 nt8.97□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 KKQ8YKL168C 2175 nt8.96□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 RPT6YGL048C 1218 nt8.96□□□□□ -0.97
TY1B-BRQ12193 YCL065WYCL065W 369 nt8.96□□□□□ -0.98
TY1B-BRQ12193 SAM4YPL273W 978 nt8.96□□□□□ -0.98
TY1B-BRQ12193 PMT3YOR321W 2262 nt8.96□□□□□ -0.98
TY1B-BRQ12193 YJR115WYJR115W 510 nt8.95□□□□□ -0.98
TY1B-BRQ12193 OPI8YKR035C 642 nt8.95□□□□□ -0.98
TY1B-BRQ12193 YBR124WYBR124W 360 nt8.95□□□□□ -0.98
TY1B-BRQ12193 AGP2YBR132C 1791 nt8.95□□□□□ -0.98
TY1B-BRQ12193 APS3YJL024C 585 nt8.94□□□□□ -0.98
TY1B-BRQ12193 VPS61YDR136C 573 nt8.94□□□□□ -0.98
TY1B-BRQ12193 PGM1YKL127W 1713 nt8.94□□□□□ -0.98
TY1B-BRQ12193 COT1YOR316C 1320 nt8.93□□□□□ -0.98
TY1B-BRQ12193 PAC10YGR078C 600 nt8.93□□□□□ -0.98
TY1B-BRQ12193 YLL059CYLL059C 507 nt8.92□□□□□ -0.98
TY1B-BRQ12193 BNA3YJL060W 1335 nt8.92□□□□□ -0.98
TY1B-BRQ12193 YNL296WYNL296W 315 nt8.91□□□□□ -0.98
TY1B-BRQ12193 YOR318CYOR318C 306 nt8.9□□□□□ -0.98
TY1B-BRQ12193 YMR010WYMR010W 1218 nt8.89□□□□□ -0.99
TY1B-BRQ12193 YHR127WYHR127W 732 nt8.89□□□□□ -0.99
TY1B-BRQ12193 VRP1YLR337C 2454 nt8.87□□□□□ -0.99
TY1B-BRQ12193 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1B-BRQ12193 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1B-BRQ12193 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1B-BRQ12193 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1B-BRQ12193 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt8.86□□□□□ -0.99
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TY1B-BRQ12193 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1B-BRQ12193 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt8.86□□□□□ -0.99
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