Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smim24Q0VG18 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smim24Q0VG18 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smim24Q0VG18 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smim24Q0VG18 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim24Q0VG18 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim24Q0VG18 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim24Q0VG18 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim24Q0VG18 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim24Q0VG18 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim24Q0VG18 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim24Q0VG18 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim24Q0VG18 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smim24Q0VG18 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smim24Q0VG18 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Smim24Q0VG18 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smim24Q0VG18 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smim24Q0VG18 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smim24Q0VG18 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim24Q0VG18 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim24Q0VG18 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim24Q0VG18 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim24Q0VG18 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim24Q0VG18 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim24Q0VG18 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim24Q0VG18 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms