Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hif3aQ0VBL6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hif3aQ0VBL6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms