Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tigd2Q0VBL1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tigd2Q0VBL1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tigd2Q0VBL1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tigd2Q0VBL1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tigd2Q0VBL1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tigd2Q0VBL1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tigd2Q0VBL1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tigd2Q0VBL1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tigd2Q0VBL1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.1 ms