Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
StumQ0VBF8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
StumQ0VBF8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms