Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T9

Cntnap5a, Contactin-associated protein like 5-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5aQ0V8T9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap5aQ0V8T9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5aQ0V8T9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cntnap5aQ0V8T9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5aQ0V8T9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms