Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPIRE1Q08AE8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SPIRE1Q08AE8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.7 ms