Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGM3Q08188 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.6 ms