Protein–RNA interactions for Protein: Q07869

PPARA, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARAQ07869 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPARAQ07869 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARAQ07869 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARAQ07869 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARAQ07869 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARAQ07869 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARAQ07869 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARAQ07869 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARAQ07869 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARAQ07869 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARAQ07869 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARAQ07869 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARAQ07869 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARAQ07869 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PPARAQ07869 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.6 ms