Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PSME1Q06323 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PSME1Q06323 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PSME1Q06323 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PSME1Q06323 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PSME1Q06323 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
PSME1Q06323 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PSME1Q06323 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PSME1Q06323 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PSME1Q06323 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PSME1Q06323 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PSME1Q06323 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PSME1Q06323 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PSME1Q06323 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PSME1Q06323 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PSME1Q06323 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PSME1Q06323 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PSME1Q06323 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PSME1Q06323 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PSME1Q06323 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PSME1Q06323 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PSME1Q06323 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PSME1Q06323 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PSME1Q06323 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PSME1Q06323 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PSME1Q06323 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PSME1Q06323 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PSME1Q06323 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PSME1Q06323 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PSME1Q06323 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PSME1Q06323 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PSME1Q06323 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PSME1Q06323 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PSME1Q06323 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PSME1Q06323 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
PSME1Q06323 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PSME1Q06323 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PSME1Q06323 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PSME1Q06323 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PSME1Q06323 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PSME1Q06323 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PSME1Q06323 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PSME1Q06323 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PSME1Q06323 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PSME1Q06323 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PSME1Q06323 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PSME1Q06323 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PSME1Q06323 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PSME1Q06323 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PSME1Q06323 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PSME1Q06323 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PSME1Q06323 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PSME1Q06323 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PSME1Q06323 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PSME1Q06323 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PSME1Q06323 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PSME1Q06323 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PSME1Q06323 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PSME1Q06323 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PSME1Q06323 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PSME1Q06323 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PSME1Q06323 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PSME1Q06323 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms