Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DEUP1Q05D60 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DEUP1Q05D60 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms