Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r236Q05A06 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r236Q05A06 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms