Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC18A2Q05940 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18A2Q05940 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms