Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PtprgQ05909 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PtprgQ05909 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
PtprgQ05909 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PtprgQ05909 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PtprgQ05909 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PtprgQ05909 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PtprgQ05909 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PtprgQ05909 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PtprgQ05909 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprgQ05909 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprgQ05909 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprgQ05909 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprgQ05909 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PtprgQ05909 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PtprgQ05909 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PtprgQ05909 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PtprgQ05909 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PtprgQ05909 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PtprgQ05909 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PtprgQ05909 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PtprgQ05909 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PtprgQ05909 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PtprgQ05909 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PtprgQ05909 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PtprgQ05909 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PtprgQ05909 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PtprgQ05909 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PtprgQ05909 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PtprgQ05909 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PtprgQ05909 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PtprgQ05909 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PtprgQ05909 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PtprgQ05909 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PtprgQ05909 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PtprgQ05909 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PtprgQ05909 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PtprgQ05909 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PtprgQ05909 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PtprgQ05909 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprgQ05909 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprgQ05909 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprgQ05909 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprgQ05909 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PtprgQ05909 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PtprgQ05909 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PtprgQ05909 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PtprgQ05909 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PtprgQ05909 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PtprgQ05909 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprgQ05909 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprgQ05909 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PtprgQ05909 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
PtprgQ05909 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PtprgQ05909 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PtprgQ05909 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PtprgQ05909 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprgQ05909 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprgQ05909 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprgQ05909 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprgQ05909 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprgQ05909 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PtprgQ05909 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PtprgQ05909 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
PtprgQ05909 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PtprgQ05909 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PtprgQ05909 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PtprgQ05909 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
PtprgQ05909 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PtprgQ05909 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PtprgQ05909 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PtprgQ05909 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PtprgQ05909 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PtprgQ05909 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PtprgQ05909 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PtprgQ05909 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PtprgQ05909 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PtprgQ05909 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PtprgQ05909 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprgQ05909 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprgQ05909 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprgQ05909 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PtprgQ05909 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PtprgQ05909 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PtprgQ05909 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PtprgQ05909 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PtprgQ05909 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms