Protein–RNA interactions for Protein: Q04007

SND1, SRP-independent targeting protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SND1Q04007 VMA3YEL027W 483 nt6.71□□□□□ -1.34
SND1Q04007 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt6.71□□□□□ -1.34
SND1Q04007 MIA40YKL195W 1212 nt6.71□□□□□ -1.34
SND1Q04007 TSR2YLR435W 618 nt6.71□□□□□ -1.34
SND1Q04007 MTQ1YNL063W 945 nt6.71□□□□□ -1.34
SND1Q04007 RUF23RUF23 254 nt6.71□□□□□ -1.34
SND1Q04007 TOS6YNL300W 309 nt6.71□□□□□ -1.34
SND1Q04007 YBL112CYBL112C 318 nt6.71□□□□□ -1.34
SND1Q04007 FRE5YOR384W 2085 nt6.71□□□□□ -1.34
SND1Q04007 MKC7YDR144C 1791 nt6.71□□□□□ -1.34
SND1Q04007 FAL1YDR021W 1200 nt6.7□□□□□ -1.34
SND1Q04007 LYS1YIR034C 1122 nt6.7□□□□□ -1.34
SND1Q04007 MDH1YKL085W 1005 nt6.7□□□□□ -1.34
SND1Q04007 YBR027CYBR027C 333 nt6.7□□□□□ -1.34
SND1Q04007 CTF19YPL018W 1110 nt6.7□□□□□ -1.34
SND1Q04007 FET3YMR058W 1911 nt6.7□□□□□ -1.34
SND1Q04007 YDR415CYDR415C 1125 nt6.69□□□□□ -1.34
SND1Q04007 POR2YIL114C 846 nt6.69□□□□□ -1.34
SND1Q04007 YKR045CYKR045C 552 nt6.69□□□□□ -1.34
SND1Q04007 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt6.69□□□□□ -1.34
SND1Q04007 YOL079WYOL079W 399 nt6.69□□□□□ -1.34
SND1Q04007 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.69□□□□□ -1.34
SND1Q04007 YPL257WYPL257W 582 nt6.69□□□□□ -1.34
SND1Q04007 CCT8YJL008C 1707 nt6.69□□□□□ -1.34
SND1Q04007 GPD2YOL059W 1323 nt6.69□□□□□ -1.34
SND1Q04007 EDC3YEL015W 1656 nt6.68□□□□□ -1.34
SND1Q04007 RTT103YDR289C 1230 nt6.68□□□□□ -1.34
SND1Q04007 YPT1YFL038C 621 nt6.68□□□□□ -1.34
SND1Q04007 DID2YKR035W-A 615 nt6.68□□□□□ -1.34
SND1Q04007 SUR7YML052W 909 nt6.68□□□□□ -1.34
SND1Q04007 OGG1YML060W 1131 nt6.68□□□□□ -1.34
SND1Q04007 YMR252CYMR252C 405 nt6.68□□□□□ -1.34
SND1Q04007 UIP5YKR044W 1332 nt6.68□□□□□ -1.34
SND1Q04007 HEM1YDR232W 1647 nt6.68□□□□□ -1.34
SND1Q04007 ASN1YPR145W 1719 nt6.67□□□□□ -1.34
SND1Q04007 TFG2YGR005C 1203 nt6.67□□□□□ -1.34
SND1Q04007 YJR107WYJR107W 987 nt6.67□□□□□ -1.34
SND1Q04007 YKR032WYKR032W 315 nt6.67□□□□□ -1.34
SND1Q04007 DOM34YNL001W 1161 nt6.67□□□□□ -1.34
SND1Q04007 ALG5YPL227C 1005 nt6.67□□□□□ -1.34
SND1Q04007 YPL245WYPL245W 1365 nt6.67□□□□□ -1.34
SND1Q04007 MMS21YEL019C 804 nt6.66□□□□□ -1.34
SND1Q04007 GAL83YER027C 1254 nt6.66□□□□□ -1.34
SND1Q04007 SOH1YGL127C 384 nt6.66□□□□□ -1.34
SND1Q04007 YLR184WYLR184W 348 nt6.66□□□□□ -1.34
SND1Q04007 MMR1YLR190W 1476 nt6.66□□□□□ -1.34
SND1Q04007 ZWF1YNL241C 1518 nt6.66□□□□□ -1.34
SND1Q04007 OSW2YLR054C 2175 nt6.65□□□□□ -1.34
SND1Q04007 GTO1YGR154C 1071 nt6.65□□□□□ -1.34
SND1Q04007 YJR115WYJR115W 510 nt6.65□□□□□ -1.34
SND1Q04007 GLN3YER040W 2193 nt6.64□□□□□ -1.35
SND1Q04007 YCR006CYCR006C 474 nt6.64□□□□□ -1.35
SND1Q04007 RAM1YDL090C 1296 nt6.64□□□□□ -1.35
SND1Q04007 UPS3YDR185C 540 nt6.64□□□□□ -1.35
SND1Q04007 KRE9YJL174W 831 nt6.64□□□□□ -1.35
SND1Q04007 DRE2YKR071C 1047 nt6.64□□□□□ -1.35
SND1Q04007 YMR122CYMR122C 375 nt6.64□□□□□ -1.35
SND1Q04007 HIS7YBR248C 1659 nt6.64□□□□□ -1.35
SND1Q04007 NTE1YML059C 5040 nt6.63□□□□□ -1.35
SND1Q04007 YDR187CYDR187C 519 nt6.63□□□□□ -1.35
SND1Q04007 ARH1YDR376W 1482 nt6.63□□□□□ -1.35
SND1Q04007 CUP2YGL166W 678 nt6.63□□□□□ -1.35
SND1Q04007 CTF8YHR191C 402 nt6.63□□□□□ -1.35
SND1Q04007 ERP2YAL007C 648 nt6.63□□□□□ -1.35
SND1Q04007 YLR312CYLR312C 1197 nt6.63□□□□□ -1.35
SND1Q04007 SCS7YMR272C 1155 nt6.63□□□□□ -1.35
SND1Q04007 COX5AYNL052W 462 nt6.63□□□□□ -1.35
SND1Q04007 YNL120CYNL120C 486 nt6.63□□□□□ -1.35
SND1Q04007 SRV2YNL138W 1581 nt6.63□□□□□ -1.35
SND1Q04007 TAE1YBR261C 699 nt6.63□□□□□ -1.35
SND1Q04007 ACO1YLR304C 2337 nt6.62□□□□□ -1.35
SND1Q04007 ARE2YNR019W 1929 nt6.62□□□□□ -1.35
SND1Q04007 CDC1YDR182W 1476 nt6.61□□□□□ -1.35
SND1Q04007 TDH2YJR009C 999 nt6.61□□□□□ -1.35
SND1Q04007 MDE1YJR024C 735 nt6.61□□□□□ -1.35
SND1Q04007 FBA1YKL060C 1080 nt6.61□□□□□ -1.35
SND1Q04007 SCP1YOR367W 603 nt6.61□□□□□ -1.35
SND1Q04007 TKL2YBR117C 2046 nt6.6□□□□□ -1.35
SND1Q04007 SLX5YDL013W 1860 nt6.6□□□□□ -1.35
SND1Q04007 IMA2YOL157C 1770 nt6.6□□□□□ -1.35
SND1Q04007 PEX3YDR329C 1326 nt6.6□□□□□ -1.35
SND1Q04007 WTM1YOR230W 1314 nt6.6□□□□□ -1.35
SND1Q04007 MRPL25YGR076C 474 nt6.6□□□□□ -1.35
SND1Q04007 LDB16YCL005W 771 nt6.6□□□□□ -1.35
SND1Q04007 YMR279CYMR279C 1623 nt6.6□□□□□ -1.35
SND1Q04007 PTC3YBL056W 1407 nt6.59□□□□□ -1.35
SND1Q04007 UTP9YHR196W 1728 nt6.59□□□□□ -1.35
SND1Q04007 YLH47YPR125W 1365 nt6.59□□□□□ -1.35
SND1Q04007 THI2YBR240C 1353 nt6.59□□□□□ -1.35
SND1Q04007 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt6.59□□□□□ -1.35
SND1Q04007 SPC42YKL042W 1092 nt6.59□□□□□ -1.35
SND1Q04007 SRL2YLR082C 1179 nt6.59□□□□□ -1.35
SND1Q04007 GIT1YCR098C 1557 nt6.59□□□□□ -1.35
SND1Q04007 SKI2YLR398C 3864 nt6.59□□□□□ -1.35
SND1Q04007 YDR132CYDR132C 1488 nt6.59□□□□□ -1.36
SND1Q04007 ICE2YIL090W 1476 nt6.59□□□□□ -1.36
SND1Q04007 MSY1YPL097W 1479 nt6.59□□□□□ -1.36
SND1Q04007 YGR054WYGR054W 1929 nt6.58□□□□□ -1.36
SND1Q04007 HMLALPHA1YCL066W 528 nt6.58□□□□□ -1.36
SND1Q04007 MATALPHA1YCR040W 528 nt6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.9 ms