Protein–RNA interactions for Protein: Q03401

Crisp1, Cysteine-rich secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp1Q03401 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Crisp1Q03401 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Crisp1Q03401 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Crisp1Q03401 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms