Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PrkczQ02956 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkczQ02956 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms