Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NUCB1Q02818 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUCB1Q02818 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUCB1Q02818 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.6 ms