Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCEQ02156 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRKCEQ02156 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms