Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snai1Q02085 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snai1Q02085 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snai1Q02085 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snai1Q02085 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Snai1Q02085 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Snai1Q02085 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Snai1Q02085 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Snai1Q02085 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Snai1Q02085 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Snai1Q02085 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Snai1Q02085 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Snai1Q02085 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Snai1Q02085 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snai1Q02085 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snai1Q02085 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snai1Q02085 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snai1Q02085 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snai1Q02085 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snai1Q02085 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snai1Q02085 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Snai1Q02085 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snai1Q02085 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snai1Q02085 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snai1Q02085 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snai1Q02085 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snai1Q02085 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snai1Q02085 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snai1Q02085 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snai1Q02085 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snai1Q02085 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Snai1Q02085 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Snai1Q02085 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Snai1Q02085 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Snai1Q02085 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Snai1Q02085 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snai1Q02085 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snai1Q02085 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Snai1Q02085 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Snai1Q02085 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Snai1Q02085 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Snai1Q02085 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Snai1Q02085 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Snai1Q02085 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Snai1Q02085 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Snai1Q02085 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Snai1Q02085 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Snai1Q02085 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snai1Q02085 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snai1Q02085 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snai1Q02085 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snai1Q02085 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snai1Q02085 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snai1Q02085 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snai1Q02085 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Snai1Q02085 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Snai1Q02085 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms