Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE1BQ01064 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE1BQ01064 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.8 ms