Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SeleQ00690 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SeleQ00690 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SeleQ00690 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SeleQ00690 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SeleQ00690 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SeleQ00690 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SeleQ00690 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SeleQ00690 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SeleQ00690 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SeleQ00690 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SeleQ00690 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SeleQ00690 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SeleQ00690 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SeleQ00690 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SeleQ00690 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SeleQ00690 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SeleQ00690 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SeleQ00690 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SeleQ00690 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SeleQ00690 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SeleQ00690 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SeleQ00690 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SeleQ00690 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SeleQ00690 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SeleQ00690 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SeleQ00690 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SeleQ00690 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SeleQ00690 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SeleQ00690 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SeleQ00690 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SeleQ00690 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SeleQ00690 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SeleQ00690 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SeleQ00690 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SeleQ00690 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SeleQ00690 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SeleQ00690 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SeleQ00690 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SeleQ00690 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SeleQ00690 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SeleQ00690 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SeleQ00690 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SeleQ00690 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SeleQ00690 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms