Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSF1Q00613 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSF1Q00613 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms