Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx2Q00262 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms