Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGD1P98174 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD1P98174 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD1P98174 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD1P98174 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD1P98174 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
FGD1P98174 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGD1P98174 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGD1P98174 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGD1P98174 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGD1P98174 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGD1P98174 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGD1P98174 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD1P98174 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD1P98174 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD1P98174 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD1P98174 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD1P98174 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD1P98174 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD1P98174 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD1P98174 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGD1P98174 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGD1P98174 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGD1P98174 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGD1P98174 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGD1P98174 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGD1P98174 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGD1P98174 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGD1P98174 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGD1P98174 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGD1P98174 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGD1P98174 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGD1P98174 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGD1P98174 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGD1P98174 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGD1P98174 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FGD1P98174 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGD1P98174 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGD1P98174 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGD1P98174 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGD1P98174 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGD1P98174 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGD1P98174 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGD1P98174 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGD1P98174 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGD1P98174 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGD1P98174 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FGD1P98174 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
FGD1P98174 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD1P98174 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD1P98174 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD1P98174 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD1P98174 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD1P98174 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD1P98174 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD1P98174 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD1P98174 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD1P98174 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD1P98174 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD1P98174 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD1P98174 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD1P98174 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD1P98174 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD1P98174 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD1P98174 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD1P98174 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD1P98174 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD1P98174 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD1P98174 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD1P98174 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD1P98174 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD1P98174 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD1P98174 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD1P98174 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD1P98174 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD1P98174 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD1P98174 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGD1P98174 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGD1P98174 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGD1P98174 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FGD1P98174 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FGD1P98174 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD1P98174 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD1P98174 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD1P98174 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD1P98174 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD1P98174 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD1P98174 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD1P98174 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD1P98174 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD1P98174 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGD1P98174 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGD1P98174 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGD1P98174 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FGD1P98174 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FGD1P98174 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FGD1P98174 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FGD1P98174 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FGD1P98174 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FGD1P98174 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms