Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Apba2P98084 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Apba2P98084 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Apba2P98084 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Apba2P98084 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Apba2P98084 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Apba2P98084 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Apba2P98084 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Apba2P98084 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Apba2P98084 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Apba2P98084 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Apba2P98084 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Apba2P98084 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Apba2P98084 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Apba2P98084 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Apba2P98084 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Apba2P98084 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Apba2P98084 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Apba2P98084 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Apba2P98084 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Apba2P98084 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Apba2P98084 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Apba2P98084 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Apba2P98084 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Apba2P98084 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Apba2P98084 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Apba2P98084 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Apba2P98084 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Apba2P98084 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Apba2P98084 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Apba2P98084 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Apba2P98084 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Apba2P98084 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Apba2P98084 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Apba2P98084 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Apba2P98084 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Apba2P98084 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Apba2P98084 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Apba2P98084 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Apba2P98084 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Apba2P98084 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Apba2P98084 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Apba2P98084 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Apba2P98084 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Apba2P98084 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Apba2P98084 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Apba2P98084 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Apba2P98084 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Apba2P98084 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Apba2P98084 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Apba2P98084 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Apba2P98084 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Apba2P98084 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Apba2P98084 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Apba2P98084 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Apba2P98084 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Apba2P98084 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Apba2P98084 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Apba2P98084 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Apba2P98084 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Apba2P98084 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Apba2P98084 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Apba2P98084 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Apba2P98084 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Apba2P98084 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Apba2P98084 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Apba2P98084 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221.9 ms