Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VegfcP97953 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VegfcP97953 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VegfcP97953 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VegfcP97953 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VegfcP97953 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VegfcP97953 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VegfcP97953 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms