Protein–RNA interactions for Protein: P97798

Neo1, Neogenin, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neo1P97798 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Neo1P97798 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Neo1P97798 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Neo1P97798 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Neo1P97798 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Neo1P97798 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Neo1P97798 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Neo1P97798 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Neo1P97798 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Neo1P97798 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Neo1P97798 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Neo1P97798 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Neo1P97798 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Neo1P97798 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Neo1P97798 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Neo1P97798 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Neo1P97798 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Neo1P97798 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Neo1P97798 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Neo1P97798 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Neo1P97798 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Neo1P97798 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Neo1P97798 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Neo1P97798 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Neo1P97798 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Neo1P97798 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Neo1P97798 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Neo1P97798 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Neo1P97798 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Neo1P97798 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Neo1P97798 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Neo1P97798 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Neo1P97798 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Neo1P97798 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Neo1P97798 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Neo1P97798 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Neo1P97798 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Neo1P97798 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Neo1P97798 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Neo1P97798 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Neo1P97798 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Neo1P97798 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Neo1P97798 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Neo1P97798 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Neo1P97798 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Neo1P97798 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Neo1P97798 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Neo1P97798 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Neo1P97798 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Neo1P97798 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Neo1P97798 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Neo1P97798 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Neo1P97798 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Neo1P97798 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Neo1P97798 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Neo1P97798 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Neo1P97798 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Neo1P97798 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Neo1P97798 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Neo1P97798 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Neo1P97798 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Neo1P97798 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Neo1P97798 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Neo1P97798 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Neo1P97798 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Neo1P97798 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Neo1P97798 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Neo1P97798 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Neo1P97798 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Neo1P97798 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Neo1P97798 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Neo1P97798 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Neo1P97798 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Neo1P97798 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Neo1P97798 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms