Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gata5P97489 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gata5P97489 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gata5P97489 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gata5P97489 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gata5P97489 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gata5P97489 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gata5P97489 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gata5P97489 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gata5P97489 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gata5P97489 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gata5P97489 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gata5P97489 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gata5P97489 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gata5P97489 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gata5P97489 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gata5P97489 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gata5P97489 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gata5P97489 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gata5P97489 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gata5P97489 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gata5P97489 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gata5P97489 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gata5P97489 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gata5P97489 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gata5P97489 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gata5P97489 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gata5P97489 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gata5P97489 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gata5P97489 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gata5P97489 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gata5P97489 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gata5P97489 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gata5P97489 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gata5P97489 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gata5P97489 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gata5P97489 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gata5P97489 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gata5P97489 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gata5P97489 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gata5P97489 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gata5P97489 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gata5P97489 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gata5P97489 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gata5P97489 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gata5P97489 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gata5P97489 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gata5P97489 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gata5P97489 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gata5P97489 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gata5P97489 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gata5P97489 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms