Protein–RNA interactions for Protein: P97470

Ppp4c, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4cP97470 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppp4cP97470 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppp4cP97470 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppp4cP97470 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppp4cP97470 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppp4cP97470 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppp4cP97470 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppp4cP97470 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppp4cP97470 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppp4cP97470 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppp4cP97470 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppp4cP97470 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppp4cP97470 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppp4cP97470 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppp4cP97470 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppp4cP97470 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppp4cP97470 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppp4cP97470 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppp4cP97470 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppp4cP97470 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppp4cP97470 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppp4cP97470 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppp4cP97470 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppp4cP97470 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppp4cP97470 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppp4cP97470 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ppp4cP97470 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppp4cP97470 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppp4cP97470 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp4cP97470 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp4cP97470 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp4cP97470 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp4cP97470 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp4cP97470 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp4cP97470 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp4cP97470 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp4cP97470 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp4cP97470 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp4cP97470 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp4cP97470 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp4cP97470 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp4cP97470 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms