Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tubg1P83887 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms