Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAE1P78406 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAE1P78406 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAE1P78406 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAE1P78406 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAE1P78406 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAE1P78406 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAE1P78406 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAE1P78406 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAE1P78406 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAE1P78406 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAE1P78406 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAE1P78406 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAE1P78406 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAE1P78406 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAE1P78406 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAE1P78406 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAE1P78406 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAE1P78406 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAE1P78406 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAE1P78406 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAE1P78406 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAE1P78406 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAE1P78406 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAE1P78406 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAE1P78406 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAE1P78406 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAE1P78406 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAE1P78406 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAE1P78406 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAE1P78406 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAE1P78406 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAE1P78406 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAE1P78406 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAE1P78406 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAE1P78406 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAE1P78406 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAE1P78406 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAE1P78406 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAE1P78406 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAE1P78406 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAE1P78406 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAE1P78406 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAE1P78406 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAE1P78406 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAE1P78406 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAE1P78406 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAE1P78406 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAE1P78406 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAE1P78406 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAE1P78406 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAE1P78406 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAE1P78406 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAE1P78406 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAE1P78406 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAE1P78406 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAE1P78406 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAE1P78406 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAE1P78406 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAE1P78406 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAE1P78406 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAE1P78406 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAE1P78406 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAE1P78406 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAE1P78406 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAE1P78406 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAE1P78406 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAE1P78406 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAE1P78406 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAE1P78406 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAE1P78406 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAE1P78406 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAE1P78406 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAE1P78406 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAE1P78406 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAE1P78406 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAE1P78406 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAE1P78406 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAE1P78406 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAE1P78406 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAE1P78406 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAE1P78406 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAE1P78406 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAE1P78406 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAE1P78406 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAE1P78406 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAE1P78406 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAE1P78406 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAE1P78406 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAE1P78406 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAE1P78406 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAE1P78406 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAE1P78406 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAE1P78406 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAE1P78406 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAE1P78406 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAE1P78406 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAE1P78406 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAE1P78406 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAE1P78406 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms