Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PHC1P78364 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHC1P78364 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHC1P78364 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHC1P78364 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHC1P78364 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHC1P78364 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHC1P78364 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHC1P78364 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHC1P78364 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHC1P78364 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHC1P78364 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHC1P78364 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHC1P78364 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHC1P78364 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHC1P78364 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHC1P78364 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PHC1P78364 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHC1P78364 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHC1P78364 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHC1P78364 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHC1P78364 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHC1P78364 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHC1P78364 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHC1P78364 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHC1P78364 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHC1P78364 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHC1P78364 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHC1P78364 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHC1P78364 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHC1P78364 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHC1P78364 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHC1P78364 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHC1P78364 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHC1P78364 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHC1P78364 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHC1P78364 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHC1P78364 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHC1P78364 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHC1P78364 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHC1P78364 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHC1P78364 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHC1P78364 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHC1P78364 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHC1P78364 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHC1P78364 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHC1P78364 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHC1P78364 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHC1P78364 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHC1P78364 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHC1P78364 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHC1P78364 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHC1P78364 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHC1P78364 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PHC1P78364 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHC1P78364 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHC1P78364 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHC1P78364 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHC1P78364 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PHC1P78364 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHC1P78364 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHC1P78364 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHC1P78364 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHC1P78364 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHC1P78364 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHC1P78364 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHC1P78364 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHC1P78364 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHC1P78364 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHC1P78364 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHC1P78364 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHC1P78364 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHC1P78364 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHC1P78364 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHC1P78364 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHC1P78364 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHC1P78364 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHC1P78364 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHC1P78364 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHC1P78364 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PHC1P78364 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHC1P78364 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHC1P78364 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHC1P78364 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHC1P78364 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHC1P78364 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHC1P78364 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHC1P78364 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHC1P78364 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHC1P78364 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHC1P78364 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHC1P78364 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHC1P78364 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHC1P78364 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHC1P78364 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHC1P78364 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHC1P78364 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHC1P78364 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PHC1P78364 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHC1P78364 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms