Protein–RNA interactions for Protein: P70407

Cdh9, Cadherin-9, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh9P70407 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh9P70407 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdh9P70407 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms