Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chl1P70232 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Chl1P70232 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chl1P70232 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chl1P70232 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chl1P70232 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chl1P70232 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chl1P70232 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Chl1P70232 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chl1P70232 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chl1P70232 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Chl1P70232 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chl1P70232 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Chl1P70232 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Chl1P70232 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chl1P70232 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Chl1P70232 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chl1P70232 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chl1P70232 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chl1P70232 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Chl1P70232 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chl1P70232 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chl1P70232 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chl1P70232 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chl1P70232 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chl1P70232 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Chl1P70232 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Chl1P70232 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chl1P70232 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chl1P70232 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chl1P70232 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chl1P70232 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chl1P70232 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chl1P70232 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chl1P70232 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chl1P70232 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chl1P70232 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chl1P70232 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chl1P70232 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chl1P70232 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chl1P70232 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chl1P70232 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chl1P70232 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chl1P70232 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chl1P70232 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chl1P70232 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chl1P70232 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chl1P70232 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chl1P70232 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chl1P70232 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chl1P70232 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms