Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubb4bP68372 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb4bP68372 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb4bP68372 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb4bP68372 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb4bP68372 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms