Protein–RNA interactions for Protein: P67809

YBX1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1P67809 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
YBX1P67809 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBX1P67809 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBX1P67809 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBX1P67809 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBX1P67809 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBX1P67809 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBX1P67809 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
YBX1P67809 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
YBX1P67809 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YBX1P67809 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YBX1P67809 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
YBX1P67809 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YBX1P67809 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
YBX1P67809 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YBX1P67809 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
YBX1P67809 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YBX1P67809 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YBX1P67809 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YBX1P67809 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YBX1P67809 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YBX1P67809 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YBX1P67809 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YBX1P67809 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YBX1P67809 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YBX1P67809 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YBX1P67809 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBX1P67809 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBX1P67809 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBX1P67809 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBX1P67809 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBX1P67809 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBX1P67809 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YBX1P67809 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YBX1P67809 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YBX1P67809 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
YBX1P67809 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YBX1P67809 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YBX1P67809 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YBX1P67809 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YBX1P67809 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YBX1P67809 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YBX1P67809 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
YBX1P67809 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YBX1P67809 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YBX1P67809 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX1P67809 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX1P67809 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX1P67809 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX1P67809 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX1P67809 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX1P67809 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX1P67809 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX1P67809 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX1P67809 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX1P67809 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YBX1P67809 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YBX1P67809 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YBX1P67809 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YBX1P67809 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YBX1P67809 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YBX1P67809 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX1P67809 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX1P67809 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX1P67809 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX1P67809 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX1P67809 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX1P67809 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YBX1P67809 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YBX1P67809 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YBX1P67809 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YBX1P67809 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YBX1P67809 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YBX1P67809 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YBX1P67809 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YBX1P67809 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YBX1P67809 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YBX1P67809 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YBX1P67809 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
YBX1P67809 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YBX1P67809 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YBX1P67809 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
YBX1P67809 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YBX1P67809 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YBX1P67809 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YBX1P67809 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YBX1P67809 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YBX1P67809 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YBX1P67809 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YBX1P67809 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YBX1P67809 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YBX1P67809 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
YBX1P67809 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
YBX1P67809 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
YBX1P67809 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
YBX1P67809 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YBX1P67809 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YBX1P67809 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YBX1P67809 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YBX1P67809 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms