Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2IP63279 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2IP63279 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms