Protein–RNA interactions for Protein: P62878

Rbx1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbx1P62878 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbx1P62878 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbx1P62878 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms