Protein–RNA interactions for Protein: P62754

Rps6, 40S ribosomal protein S6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6P62754 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rps6P62754 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rps6P62754 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rps6P62754 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rps6P62754 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rps6P62754 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rps6P62754 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rps6P62754 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rps6P62754 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rps6P62754 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rps6P62754 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rps6P62754 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rps6P62754 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rps6P62754 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rps6P62754 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rps6P62754 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rps6P62754 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rps6P62754 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rps6P62754 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rps6P62754 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rps6P62754 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rps6P62754 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rps6P62754 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rps6P62754 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rps6P62754 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rps6P62754 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rps6P62754 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rps6P62754 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rps6P62754 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rps6P62754 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rps6P62754 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rps6P62754 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rps6P62754 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rps6P62754 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rps6P62754 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rps6P62754 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rps6P62754 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rps6P62754 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rps6P62754 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rps6P62754 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rps6P62754 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rps6P62754 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rps6P62754 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rps6P62754 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rps6P62754 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rps6P62754 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rps6P62754 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rps6P62754 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rps6P62754 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms